En medio de un clima algo enrarecido por la suspensión decretada por FIFA en contra de Perú se realizo el sorteo de los grupos y llaves previas para la Copa Libertadores 2009. El grupo 1 estará conformado por el campeón reinante la Liga Universitaria de Quito, el Sport Recife de Brasil, el segundo equipo clasificado de Chile y el ganador de la llave que enfrente a unos de los equipos de Brasil y al tercer clasificado de Bolivia.

En el grupo 2 estarán el Táchira de Venezuela, el tercer equipo que clasifique por Argentina, el segundo de Paraguay y el ganador del choque entre el tercero de Ecuador y el Deportivo Anzoátegui de Venezuela. El grupo 3 estará conformado por River Plate, Nacional de Uruguay, el puesto vacante dejado por el segundo de Perú y el ganador de la llave que enfrentara al cuarto equipo por Ecuador y al tercero de Paraguay. El grupo 4 tiene al Defensor Sporting de Uruguay al número 1 de Brasil, al segundo de Colombia y al ganador de la llave entre el tercero de Colombia y el Peñarol de Uruguay. En el grupo 5 estarán Universitario de Sucre Bolivia, el tercero de Brasil, el segundo de Ecuador y el ganador de la llave entre el quinto de Argentina y el puesto vacante dejado por el tercero de Perú, que en caso de levantarse la sanción sería el Sporting Cristal. El grupo 6 será conformado por Lanús de Argentina, Everton de Chile, Caracas de Venezuela y el segundo de México.

El grupo 7 tiene al Aurora de Bolivia, al Deportivo Chicó de Colombia, al segundo de Brasil y al ganador de la llave entre el tercero de México y la Universidad de Chile. Finalmente el grupo 8 tendrá a Libertad de Paraguay, al San Luis de México al cuarto de Argentina y al equipo que ocupe el puesto vacante dejado por Perú que inicialmente estaba reservado para Universitario. Como se ve en la mayoría de casos los nombres de los equipos se definirán recién en días previos al fin de año, cuando se terminen los campeonatos locales y cuando la FIFA decida si levanta o confirma la sanción en contra de Perú.